Если вам нужно удалить неактуальные подписи из списка подписантов в КриптоАРМ 5й версии, делайте это через оснастку или КриптоПро. Фокус в том, что арма может зацепить не только открытую часть подписи, но и контейнер целиком.
Если вы видите что-то около данного изображения:
Нажимать на ДА не стоит, потрётся всё что связанно с конкретной ЭП.